Сейчас расскажу какие настройки можно подкрутить в Битриксе для начала его отладки.

1) Отключаем в .htaccess auto_prepend_file /bitrix/modules/security/tools/start.php

2) Включаем логи в Битрикс /bitrix/.settings.php

  'exception_handling' =>
  array (
    'value' =>
    array (
      'debug' => true,
      'handled_errors_types' => E_ALL & ~E_NOTICE & ~E_STRICT & ~E_USER_NOTICE & ~E_DEPRECATED,
      'exception_errors_types' => E_ALL & ~E_NOTICE & ~E_WARNING & ~E_STRICT & ~E_USER_WARNING & ~E_USER_NOTICE & ~E_COMPILE_WARNING,
      'ignore_silence' => true,
      'assertion_throws_exception' => false,
      'assertion_error_type' => 256,
      'log' => array (
        'settings' => array (
          'file' => 'bitrix/modules/error.log',
          'log_size' => 1000000,
        ),
    ),
    ),
    'readonly' => true,
  ),

3) Или в php.ini

display_errors display_startup_errors error_log

4) Отладка выгрузки 1С

init.php

AddEventHandler("main", "OnEndBufferContent", "ChangeMyContent");
function ChangeMyContent($content)
{
    if (strpos($_SERVER['REQUEST_URI'],'/bitrix/admin/1c_exchange.php')!==false) {
        $codabra = date("Y-m-d H:i:s")."\n";
        $codabra.= $content."\n";
        $codabra.= $_SERVER['REQUEST_URI']."\n";
        $codabra.= "------------------------------\n";
        file_put_contents($_SERVER["DOCUMENT_ROOT"].'/mysuperlog.log', $codabra, FILE_APPEND);
    }
}